1920年に開院。初代病院長は「日本の細菌学の父」である北里柴三郎（医学部長兼任）。医療用ロボットの導入にも積極的で、2000年3月にアジアで初めて手術用ロボット「da Vinci」を導入した。2009年複雑心奇形の患児の生体肝移植の手術を行い、世界で初めて成功。